چای سبز به طور کلی برای اکثر افراد ضرری ندارد است، اما چند نکته وجود دارد که باید در نظر بگیرید:
برخی افرادی که به کافئین حساسیت دارند، یا افرادی که دارای مشکلات قلبی یا اختلالات اضطرابی هستند، با مصرف مکرر چای سبز ممکن است عوارض جانبی خفیفی را تجربه کنند؛ مانند بی‌قراری یا مشکل خواب.
نوشیدن مقادیر زیاد چای سبز با معده خالی، به دلیل محتوای تانن و کافئین، می‌تواند باعث مشکلات گوارشی مانند حالت تهوع شود.
به زنان باردار یا شیرده توصیه می‌شود که مصرف کافئین را محدود کنند زیرا کافئین اضافی می‌تواند بر صحت مادر و جنین تأثیر بگذارد. به همین منظور زنان باردار بهتر است چای سبز ننوشند یا خیلی محدود بنوشند.
چای سبز ممکن است با برخی داروها تداخل داشته باشد. به عنوان مثال، چای سبز به دلیل محتوای ویتامین K ممکن است با رقیق کننده‌های خون مانند وارفارین تداخل داشته باشد و به طور بالقوه بر اثربخشی دارو تأثیر بگذارد. همچنین ممکن است بر نحوه متابولیسم بدن درخصوص داروهای ضد افسردگی خاص تأثیر بگذارد.